SEPYPNA lleva a cabo al menos una actividad científica anual (Congreso o Reunión científica), además de otras actividades científicas autonómicas, cursos, seminarios y conferencias. Tanto en el País Vasco, como en Madrid, están organizados programas de formación de Psicoterapeutas de Niños y Adolescentes de orientación psicoanalítica, ateniéndose a los criterios de la FEAP.
La Sociedad -desde casi su constitución- publica semestralmente una revista: "Cuadernos de Psiquiatría y Psicoterapia Infantil". Se puede acceder a los trabajos publicados en la misma a través del enlace con nuestra página web: www.sepypna.com. SEPYPNA toma iniciativas, hace gestiones, realiza informes encaminados a obtener el reconocimiento en España de las especialidades de la Salud Mental del Niño y del Adolescente, lo que tendría una gran repercusión asistencial. Además de su participación en las tareas de la FEAP y de propiciar la coordinación de las Asociaciones de Salud Mental infantil de ámbito español, SEPYPNA está vinculada internacionalmente con la American Academy of Child and Adolescent Psychiatry, la RM Intemational Association Child and Adolescent Psychiatry and Allied Professions, la European Federation for Psychoanalytic Psychotherapy y con la Unión Europea de Médicos Especialistas.